O programa chega no formato de uma proposta diferenciada que visa utilizar as expertises dos pesquisadores do Instituto Butantan para auxiliar os desafios encontrados pelo mercado de produtos biológicos. O modelo de mestrado profissional agrega dois diferentes e complementares atores sociais: o Instituto Butantan, com todo seu conhecimento acumulado nos últimos cem anos, e as empresas que contribuem para o desenvolvimento do mercado biológico. Os candidatos devem apresentar proposta de interesse biotecnológico e/ou demandas das empresas onde trabalham que possam ser desenvolvidas no parque tecnológico do Instituto Butantan.